En un rincón oscuro de la bulliciosa ciudad de Tokyo, un pasado olvidado se despierta lentamente. Kyouhei, el estudiante universitario que una vez fue un seki en la remota villa que adora a los kakashi, ahora se ve obligado a enfrentar su destino. Su decisión de dejar atrás a los kakashi y a su hermana Utao se ve amenazada cuando un misterioso nuevo enemigo aparece en escena.
Con el corazón lleno de dudas y el peso de su pasado sobre sus hombros, Kyouhei se ve obligado a desenterrar secretos enterrados durante mucho tiempo. Mientras lucha por proteger a sus seres queridos, se da cuenta de que su conexión con los kakashi es más profunda de lo que jamás imaginó.
En medio de la batalla contra un enemigo implacable, Kyouhei se enfrenta a una verdad devastadora que sacudirá los cimientos de su mundo. ¿Podrá encontrar la fuerza para abrazar su legado como seki y proteger a los que más ama, o sucumbirá ante las sombras de su pasado?
La lucha por la supervivencia, la lealtad y el destino se entrelazan en un torbellino de emociones en Kamisama Dolls.