Bajo la luna brillante de Tokio, Ren Amamiya y sus amigos se encontraban en una encrucijada. Un misterioso suceso los llevó a un lugar oculto bajo la ciudad: Mementos, un laberinto interminable lleno de sombras y secretos. Las voces susurrantes les hablaban de una misión aún más peligrosa que cualquier otra que hubieran enfrentado antes.
Los corazones corruptos de los adultos eran solo la punta del iceberg. Un enemigo desconocido estaba manipulando los hilos en las sombras, sembrando el caos y la confusión en la vida cotidiana de los habitantes de Tokio. Ren sabía que esta vez debían ir más allá, desentrañar la verdad oculta detrás de los crímenes inexplicables que amenazaban con destruir todo lo que conocían.
Con sus Personas como única arma, los Fantasmas Ladrones de Corazones se adentraron en lo más profundo de Mementos. Allí, enfrentarían sus miedos más oscuros y descubrirían la verdadera naturaleza de sus enemigos. Unidos por lazos más fuertes que la amistad, estaban determinados a desentrañar el enigma que se cernía sobre ellos, aunque eso significara desafiar al destino mismo.
La batalla por el destino de Tokio acababa de comenzar, y en el corazón de la oscuridad, Ren y sus amigos encontrarían la verdad que cambiaría sus vidas para siempre.